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AIMcS メールマガジン ー深層学習によるタンパク質水和計算の高速化ー最新活動情報掲載 No.15 (2026年8月号)
【AIMcSメールマガジン】
●2026年8月号No.15
ライフサイエンス/計算・解析グループの取り組み”深層学習によるタンパク質水和計算の高速化”についての研究成果の特集になります。どうぞ、第15回メールマガジンも、ご愛読くださいますようお願い申し上げます。
ライフサイエンス/計算・解析グループ 吉留 崇
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TOPICS
【ニュース】
◇ライフサイエンス/計算・解析グループ 取り組み
◇ライフサイエンス/計算・解析グループ 准教授 吉留 崇 紹介
【特集】
◇深層学習によるタンパク質水和計算の高速化についての成果
【活動報告】
◇所属研究者の受賞、イベント掲載、研究成果等
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【ニュース】
- ライフサイエンス/計算・解析グループ 取り組み:ー深層学習によるタンパク質水和計算の高速化ー
創薬への応用を目指し、既存のリガンド結合予測(タンパク質に特異的に結合し、その機能を制御する小分子の結合位置を予測すること)では無視されていた「水和」を顕に考慮することで、リガンド結合予測精度を向上させることを目指している。そのためには、タンパク質周りの水の分布(水和分布)を短時間に計算する必要があるが、最近、深層学習を用いて、水和分布を1分程度(既存の手法の約1/100の計算時間)で得ることに成功した。この手法を武器として、高精度なリガンド結合予測法の確立を目指している。

- ライフサイエンス/計算・解析グループ 吉留 崇 准教授紹介
ソフトマテリアル研究センター
東北大学研究者紹介
東北大学大学院工学研究科
東北大学 吉留 崇 (Takashi Yoshidome) *研究室HPはリニューアル中
先端スピントロニクス医療応用工学共同研究講座(ASPIME) (兼務)
【特集】
ー深層学習によるタンパク質水和計算の高速化の研究ーソフトマテリアル研究開発等、研究成果
JSPS課題ー科学研究費助成事業(科研費)
「深層学習に基づく水和理論」を用いたタンパク質シミュレーションの高速化 (2025年4月~)
「高速・高精度な水和理論」を用いたリガンド結合予測の精度向上 (2024年4月~)
タンパク質水和の「深層学習モデル」の展開:水和熱力学量の高速計算 (2023年4月~2025年3月)
JST CREST「次世代放射光X線ナノCT計測の確立と展開」 主たる共同研究者 (2022年10月~)
- 関連論文等研究成果
(Press Release)ナノテラスのナノCT画像からガス拡散を10秒で予測―燃料電池の高出力・長寿命化に向けた材料設計最適化へ ―
(研究分野:ナノテク・材料、基礎科学、ジャンル:産業、SDGs目標:7,9、13)
“Structure-based prediction of gas diffusion property of catalytic layer of proton exchange membrane fuel cells via manifold learning and X-ray ptychographic nano-computed tomography” (1 June 2026)
Shota Arai ,Yuki Takayama,Takashi Yoshidome
(Press Release)深層学習によりタンパク質周辺の水和解析を実用速度に―創薬への応用を目指し、従来法の計算時間を大幅に短縮 ―
(研究分野:ライフサイエンス、基礎科学、ジャンル:医療、SDGs目標:3)
”Deep GIST: Deep Learning Models for Predicting the Distribution of Hydration Thermodynamics around Proteins” (February 09, 2026)
Yusaku Fukushima; Takashi Yoshidome
”Extraction of molecular information from experimental data on liquids using manifold learning” (15 November 2024)
Shota Arai, Gota Kikugawa, Takashi Yoshidome
菊川豪太、吉留崇 (ソフトマテリアル研究センター所属) - 出版
“シミュレーション不要の水和自由エネルギー分布予測AI” ,現代化学, Vol. 664, 39(2026年7月号) - event
(2026年7月21日開催)東北大SRIS NanoTerasuセミナーシリーズ 第10回 NanoTerasuと触媒 (終了)
【活動報告】
research
(Press Release)高周波電子基板向けポリマーの耐溶剤性向上の仕組みを解明 ―シミュレーションにより硬化中の三次元ネットワーク形成過程を可視化―
(研究分野:ナノテク・材料、ジャンル:産業、SDGs目標:7,9、12)
*東北大学 研究成果ウェブサイト (2022年9月以降)
研究科名、研究分野、ジャンル、SDGs(持続可能な開発目標)の17の目標別の検索できます。No.11(2026年4月号)
(論文発表Polymer誌(2026年6月18日)掲載)”Multiscale correlation of chemical structure, lamellar, and damage evolution in short-carbon-fiber-reinforced polyamide 6 under thermo-oxidative recycling” 白須圭一准教授
(論文発表American Chemical Society (ACS)誌(2026年7月13日)掲載)”Identifying the Threshold Chain Length for Stress Overshoot in Ring-Linear Polymer Blends under Uniaxial Elongation: The Role of Multiple Threading” 村島隆浩助教
(論文発表Polymer誌(2026年9月18日)掲載)”Stoichiometry-dependent network heterogeneity during epoxy curing: Experiments and coarse-grained molecular dynamics simulations” 川越吉晃准教授
award
(受賞)百生敦教授:XNPIG 2026「XNPIG Honorary William H.F. Talbot Award」を受賞
event
(2026年9月29、30日開催)東北大学 多元物質科学研究所 創立25周年記念式典 ・ 第26回研究発表会・多友会15周年記念行事
(2026年9月2~4日開催)JASIS 2026(分析機器・科学機器総合展)出展 (ソフトマテリアル研究センター)
(2026年8月28日、9月4、11、18日 開催)2026年度みやぎ県民大学「ながれの科学」 *18 歳以上の宮城県民の方が対象
(2026年7月26-28日開催,7~10月)知のフォーラムテーマプログラム2026 “Towards New Scientific Horizons with Synchrotron Radiation”のご案内
media
(メディア)陣内浩司センター長(ソフトマテリアル研究センター)(2026年月8月1日)ゴム・プラスチックの技術専門季刊誌「ポリマーTECH Vol.30」に掲載
*多元物質科学研究所:動画チャンネル
New! 陣内研究室 動画配信されております。是非、ご覧ください。
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Q:黄銅とは? 1.銅と亜鉛の合金 2.銅とスズの合金 3.銅とニッケルの合金
A:(答え)
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次号は、2026年9月号(No.15)9月中配信予定です 。
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